為解決我國農(nóng)村義務(wù)教育經(jīng)費(fèi)方面長期存在的各級政府投入責(zé)任不明確、經(jīng)費(fèi)供需矛盾比較突出、教育資源配置不盡合理、農(nóng)民教育負(fù)擔(dān)較重等突出問題，2005年12月，國務(wù)院發(fā)出《國務(wù)院關(guān)于深化農(nóng)村義務(wù)教育經(jīng)費(fèi)保障機(jī)制改革的通知》（國發(fā)[2005]43號)，要求從2006年開始深化農(nóng)村義務(wù)教育經(jīng)費(fèi)保障機(jī)制改革。

    這次改革按照"明確各級責(zé)任、中央地方共擔(dān)、加大財(cái)政投入、提高保障水平、分步組織實(shí)施"的基本原則，逐步將農(nóng)村義務(wù)教育全面納入公共財(cái)政保障范圍，建立中央和地方分項(xiàng)目、按比例分擔(dān)的農(nóng)村義務(wù)教育經(jīng)費(fèi)保障機(jī)制。中央重點(diǎn)支持中西部地區(qū)，適當(dāng)兼顧東部部分困難地區(qū)。改革的主要內(nèi)容：一是全部免除農(nóng)村義務(wù)教育階段學(xué)生學(xué)雜費(fèi)，對貧困家庭學(xué)生免費(fèi)提供教科書并補(bǔ)助寄宿生生活費(fèi)。免學(xué)雜費(fèi)中央與地方的分擔(dān)比例，西部地區(qū)為8：2，中部地區(qū)為6：4，東部地區(qū)（除直轄市以外）分省確定。中西部地區(qū)貧困家庭學(xué)生教科書，全部由中央財(cái)政負(fù)擔(dān)。寄宿生生活費(fèi)補(bǔ)助資金，由地方財(cái)政負(fù)擔(dān)。二是提高農(nóng)村義務(wù)教育階段中小學(xué)公用經(jīng)費(fèi)保障水平。三是建立農(nóng)村義務(wù)教育階段中小學(xué)校舍維修改造長效機(jī)制。中西部地區(qū)，中央與地方按照5：5的比例予以分擔(dān)，東部地區(qū)，中央視其校舍維修改造情況予以獎勵。四是鞏固和完善農(nóng)村中小學(xué)教師工資保障機(jī)制。另外，推進(jìn)教育綜合改革，切實(shí)治理教育亂收費(fèi)。這項(xiàng)改革自2006-2010年實(shí)施，不考慮教師工資增長因素，中央和地方各級財(cái)政5年間累計(jì)新增經(jīng)費(fèi)2182億元。

    2006年，全部西部地區(qū)和中部12個試點(diǎn)縣免除學(xué)雜費(fèi)和提高公用經(jīng)費(fèi)保障水平政策均落實(shí)到位，5007萬名農(nóng)村義務(wù)教育階段學(xué)生享受了免學(xué)雜費(fèi)政策。2006年，中央財(cái)政用于保障機(jī)制改革的經(jīng)費(fèi)投入超過140億元。免除學(xué)雜費(fèi)政策實(shí)施后，西部地區(qū)平均每個小學(xué)生減負(fù)140元，初中生減負(fù)180元，中部12個試點(diǎn)縣平均每個小學(xué)生減負(fù)170元，初中生減負(fù)232元；東部地區(qū)大部分省份也主動實(shí)施了改革。農(nóng)村中小學(xué)實(shí)現(xiàn)了正常運(yùn)轉(zhuǎn)，校舍維修改造長效機(jī)制全面啟動，農(nóng)村中小學(xué)收費(fèi)行為明顯規(guī)范，一些輟學(xué)學(xué)生又回到了課堂，農(nóng)村學(xué)校的經(jīng)費(fèi)水平大幅度提高，學(xué)校出現(xiàn)了新的面貌。2007年，全國農(nóng)村義務(wù)教育階段中小學(xué)生將全部免交學(xué)雜費(fèi)。許多群眾由衷地稱贊"免交學(xué)雜費(fèi)，農(nóng)民得實(shí)惠"。

    這一改革逐步將農(nóng)村義務(wù)教育納入公共財(cái)政保障范圍，標(biāo)志著農(nóng)村公共產(chǎn)品供給方式正在發(fā)生具有劃時代意義的深刻變革。同時，實(shí)施了農(nóng)村義務(wù)教育階段學(xué)校教師特設(shè)崗位計(jì)劃，并在全國10個省份啟動新農(nóng)村衛(wèi)生新校園建設(shè)工程試點(diǎn)，為農(nóng)村義務(wù)教育加快發(fā)展注入了新的活力。